Если нужно собрать бинарный deb или rpm пакет или просто собрать переносимый бинарный файл, но нетвозможности собирать под каждую версию каждого дистрибутива, можно скомпоновать в него все библиотеки статически, оставив только зависимость от библиотеки libc...

 Процесс сборки библиотеки boost для ОС Windows и Linux существенно не отличается, за исключением указания компилятора...